醫學院在國內大學中占有相對重要地位，下面按照目前我國社會普遍認可的一些指標和數據進行排名。主要參考的指標和數據有:
    （1）七年制、八年制臨床醫學專業授予情況；
    （2）相關學科(生物、化學)的全國排名情況；
    （3）學校在國內和國際的名氣程度；
    （4）博士點/碩士點(二級學科)、國家重點學科、國家精品課程的情況；
    （5）兩院院士、長江學者、博士生導師的情況；
    （6）附屬或教學醫院、附屬科研院所的情況；
    （7）學生入學成績情況、地域優勢。
    2010年醫學院具體排名如下（滿分1000分）:
    1、清華大學（原中國協和醫科大學）——總分：990分
    2、北京大學（原北京醫科大學）——總分：945分
    3、復旦大學（原上海醫科大學）——總分：921分
    4、上海交通大學（原上海第二醫科大學）——總分：848分
    5、中山大學（原中山醫科大學）——總分：746分
    6、華中科技大學（原同濟醫科大學）——總分：724分
    7、浙江大學（原浙江醫科大學）——總分：703分
    8、四川大學（原華西醫科大學）——總分：609分
    9、中南大學（原湖南醫科大學）——總分：602分
    10、南方醫科大學（原第一軍醫大學）——總分：477分
    11、首都醫科大學——總分：472分
    12、山東大學（原山東醫科大學）——總分：455分
    13、中國醫科大學——總分：448分
    14、哈爾濱醫科大學——總分：428分
    15、吉林大學（原白求恩醫科大學）——總分：419分
    16、武漢大學（原湖北醫科大學）——總分：407分
    17、南京醫科大學——總分：394分
    18、天津醫科大學——總分：392分
    19、西安交通大學（原西安醫科大學）——總分：362分
    20、重慶醫科大學——總分：360分
    21、北京中醫藥大學——總分：358分
    22、廣州中醫藥大學——總分：341分
    23、鄭州大學（原河南醫科大學）——總分：308分
    24、蘇州大學（原蘇州醫學院）——總分：292分
    25、中國藥科大學——總分：265分（藥學）
    26、南京大學——總分：259分
    27、沈陽藥科大學——總分：250分（藥學）
    28、河北醫科大學（原河北醫學院和河北中醫學院）——總分：245分
    29、上海中醫藥大學——總分：235分
    30、成都中醫藥大學——總分：234分
    31、廣西醫科大學——總分：228分
    32、南京中醫藥大學——總分：217分
    33、黑龍江中醫藥大學——總分：207分
    34、同濟大學（原上海鐵道醫學院）——總分：197分
    35、新疆醫科大學（原新疆醫學院和新疆中醫學院）——總分：190分
    36、天津中醫藥大學——總分：189分
    37、福建醫科大學——總分：187分
    38、山東中醫藥大學——總分：186分
    39、東南大學（原南京鐵道醫學院）——總分：183分
    40、大連醫科大學——總分：182分
    41、南開大學——總分：181分
    42、山西醫科大學——總分：163分
    43、湖南中醫藥大學——總分：158分
    44、安徽醫科大學——總分：149分
    45、遼寧中醫藥大學——總分：147分
    46、暨南大學——總分：143分
    47、浙江中醫藥大學——總分：135分
    48、湖北中醫學院——總分134分
    49、蘭州大學（原蘭州醫學院）——總分：123分
    50、青島大學（原青島醫學院）——總分：115分
    51、溫州醫學院——總分：112分
    52、廈門大學（原廈門醫學院）——總分：109分
    53、中國海洋大學醫藥學院——總分：105分（藥學）
    54、廣州醫學院——總分：89分
    55、汕頭大學（原汕頭醫學院）——總分：88分
    56、福建中醫學院——總分：86分
    57、南昌大學（原江西醫學院）——總分：85分
    58、華東理工大學藥學院——總分：73分（藥學）
    59、延邊大學（原延邊醫學院）——總分：64分
    60、昆明醫學院——總分：55分
    61、長春中醫藥大學——總分：29分
    62、福州大學化學化工學院——總分：21分（藥學）
    63、青海大學（原青海醫學院）——總分：20分
    64、南華大學（原衡陽醫學院）——總分：16分
    65、西北大學化工學院——總分：14分（藥學）
    66、江蘇大學（原鎮江醫學院）——總分：11分
    67、貴陽醫學院——總分：9分
    68、哈爾濱商業大學藥學院——總分：8分（藥學）
    69、浙江工業大學藥學院——總分：8分（藥學）
    70、揚州大學（原揚州醫學院）——總分：6分
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